شناسایی عوامل باکتریایی پوسیدگی نرم غده های سیب زمینی و هویج در منطقه بستان آباد

سیب زمینی با نام علمی solanum tuberosum l. در میان گیاهان دولپه ای مهم ترین منبع تغذیه انسان و بعد از گندم، برنج و ذرت چهارمین ماده غذایی عمده جهان است. این محصول در ایران از نظر تولید سالیانه بعد از گندم، برنج، ذرت و جو در مقام پنجم قرار دارد. هویج daucus carota l. نیز یکی دیگر از محصولات زراعی مهم در کشور است که استان های آذربایجان شرقی، خوزستان، اصفهان و زنجان بیشترین سهم را در تولید هویج کشور دارا می باشند. پوسیدگی نرم باکتریایی یکی از بیماری های معمول در سیب زمینی و هویج بوده و گسترش جهانی دارد. گونه های جنس pectobacterium، dickeya، pseudomonas و bacillus عامل ایجاد بیماری مذکور می باشند. با وجود خسارت های اقتصادی ناشی از بیماری در منطقه، عوامل دخیل در ایجاد این بیماری بطور دقیق شناسایی نشده اند. هدف مطالعه حاضر بررسی عامل یا عوامل باکتریایی ایجاد کننده بیماری در منطقه می باشد. در این مطالعه 123 جدایه باکتریایی جدا شده از غده های آلوده سیب زمینی و هویج از منطقه بستان‏ آباد مورد مطالعه قرار گرفتند. با کمک روش های بیوشیمیایی و مولکولی و تست‏های بیماریزایی زیرگونه pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum در منطقه شناسایی شد. برای مطالعات مولکولی از آغازگرهای y2/y1 استفاده شد. نتایج بررسی های مولکولی با بررسی های بیوشیمیایی مطابقت داشت. زیرگونه pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum از سیب-زمینی و هویج جدا شد و بررسی های مولکولی با پرایمرهای y2/y1 تایید کننده نتایج بود. واکنش زنجیره ای پلی مراز با جفت آغازگرهای ade2/ade1 با جایگاه هدف ژن pel جهت شناسایی مولکولی dickeya dadantii انجام گرفت و نتایج نشان داد که این گونه عامل بیماری پوسیدگی نرم در منطقه نمی باشد. تعدادی از جدایه های مورد بررسی دارای خصوصیات بیوشیمیائی جنس pseudomonas spp. بودند و داده های توالی یابی ناحیه 16s rdna نشان داد که برخی جدایه‏های این باکتری می توانند در ایجاد بیماری پوسیدگی نرم دخیل باشند.